बहुजीनी वंशागति दो या अधिक जीनों द्वारा नियंत्रित किसी लक्षण की वंशागति का प्रतिरूप है। जीन एक ही या भिन्न गुणसूत्रों पर हो सकते हैं तथा प्रत्येक जीन के दो या अधिक युग्मविकल्पी हो सकते हैं। जीन अभिव्यक्ति लिंग, पोषण, नस्ल, वृद्धि दर तथा व्यायाम की मात्रा सहित अनेक कारकों से प्रभावित होती है। ये लक्षण मात्रात्मक लक्षण हैं — अर्थात् समष्टि के भीतर इनकी एक विस्तृत परास होती है। ऐसे लक्षणों में लंबाई, भार, स्वभाव, कार्यक्षमता तथा कुछ आनुवंशिक दोष सम्मिलित हैं।
एक उदाहरण मनुष्यों में लंबाई है — इसमें अनेक लक्षणप्ररूप होते हैं, प्रत्येक अगले से थोड़ा भिन्न, जो एक क्रमिक शृंखला बनाते हैं। मनुष्यों में लंबाई की कुछ विविधता आहार, व्यायाम तथा रोग जैसे पर्यावरणीय कारकों के कारण होती है। किंतु यदि पर्यावरणीय कारक स्थिर हों, तब भी हॉर्मोन स्तर जैसी बातों के कारण लंबाई में सतत विविधता बनी रहेगी। किसी अभिलक्षण का नियंत्रण करने वाले जीन जितने अधिक होंगे, संभावित जीन संयोजन तथा लक्षणप्ररूप उतने ही अधिक होंगे।
बहुजीनी वंशागति के अन्य उदाहरण हैं: मनुष्यों में त्वचा का रंग, गेहूँ के दानों का रंग, मुर्गीपालन में अंडे का भार, भेड़ में ऊन का भार। गेहूँ में दाने का रंग दो जीन युग्मों, अर्थात् बहुजीनों, द्वारा निर्धारित होता है जो युग्मविकल्पियों के संयोजन के अनुसार श्वेत से गहरे लाल तक रंगों की परास उत्पन्न करते हैं। गहरे लाल पादप समयुग्मजी AABB तथा श्वेत पादप समयुग्मजी aabb होते हैं। इन समयुग्मजियों के संकरण पर F1 संतति सभी द्वि-विषमयुग्मजी AaBb होती है।