ग्राम-धनात्मक और ग्राम-ऋणात्मक जीवाणुओं को किसमें अंतर के आधार पर विभेदित किया जाता है:
NCERT पाठ बताता है: 'जीवाणुओं को कोशिका आवरणों में अंतर और ग्राम द्वारा विकसित अभिरंजन प्रक्रिया के प्रति उनकी प्रतिक्रिया के तरीके के आधार पर दो समूहों में वर्गीकृत किया जा सकता है, अर्थात जो ग्राम अभिरंजक ग्रहण करते हैं वे ग्राम-धनात्मक और जो नहीं करते वे ग्राम-ऋणात्मक जीवाणु कहलाते हैं।'